目前实验室研究的检测技术可分为三大类：免疫学方法、核酸探针法和分子标记法，主要是检测食品或原料中重组DNA或其表达产物如蛋白质等。 sysqy.com
蛋白检测—ELISA分析法适用于无须加工的原料性食品，但对于加工品则有局限性，因为重组基因产物会因加工处理而失活、分解或消失，使检测的不确定性增加。
DNA在加工中稳定性较好，因此加工性转基因食品的检测方法常常针对DNA设计。适用于重组DNA的检测方法有DNA杂交、AFLP和PCR等。与ELISA相比，PCR灵敏度高，可用于微量分析和较多的加工品。
