细菌质体需藉由转形 (transformation) 的技术，将的引介入细菌体中，藉由寄主细菌的系统來达成复制或进行基因表现的目的。寄主细菌的选择，须视质体的种类及实验的目的而定。本实验的目的在建构一个表现质体，使的能在大肠杆菌中大量表现 GUS。
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然而，利用大肠杆菌进行外源基因的表现时，常遇到的问题是，外源基因的产物会对寄主细菌造成伤害；此外，持续不断的表现外源基因也会使寄主细菌生长减慢或无法生长。因此，必须有适当的调控机制來控制外源基因的表现。 我们所用的载体pQE31 在T5 promoter与外源基因插入地址的间，具有一段lac operon中的lacO序列，可利用lac repressor结合其上來调控T5 promoter的启动，只有在inducer (例如IPTG) 加入时，才会启动转录的进行，而lac repressor的來源则必须靠寄主提供。由于此质体为multiple copies，一般大肠杆菌菌株中lac repressor的含量不足以有效地进行调控，纵使未加入inducer，也会有外源蛋白质的表现，万一外源蛋白质对寄主造成毒害，使的无法生长，我们可能連表现质体都无法选殖到，更无法达成我们的实验目的了。 我们所选用的寄主菌株JM109 所具有的 lacIq，能够过量表现 (overproduce) lac repressor，因此可较有效地控制T5 promoter的启动。 然而，若是連JM109 这一类带有lacIq的菌株都发生问题时，就必须再更换其它的寄主菌株；例如M15[pREP4]，此菌株除了染色体上的lacI基因外，还带有能持续表现lacrepressor的质体，应可解决lac repressor 量不足的问题。
检定载体上是否接上外來的DNA 片段，常因质体不同而有不同方法，一般常利用外來DNA 片段的插入导致载体某表现形的丧失 (insertional inactivation) 來作为筛选的依据；或者可利用插入的DNA 上带有宿主所缺少的表现型进行筛选。若载体与插入DNA 皆无适当的筛选依据，则可将菌落中的质体抽出后，以限制酶作用后进行电泳分析。而我们实验中所用的质体pQE31，并没有简易快速筛选重组质体的方法可用，因此需要利用GUS 的抗体进行colony hybridization，寻找可表现出GUS的转形株；或在培养基中加入GUS 的基质，转形株若可表现出GUS，则可将基质分解使菌落呈现蓝色；或以质体快速抽取法，筛选带有正确分子量质体的转形株。 三种方法都请练习，得到的正反应株均必须再抽取质体进行限制酶分析，以进一步确认质体的正确性。
