由于抗体是大分子，以前人们认为是不能通过细胞膜的，抗体对细胞的损害作用是通过细胞外或细胞膜成分，而对细胞器的作用无法实现。1974年，Gilliam等发现抗ENA抗体可以穿透活的细胞膜进入上皮细胞内，定位于上皮细胞核，从而提出了抗体能够进入活细胞发挥作用的新观点。从此，对于抗体穿透机制及其在自身免疫性疾病中作用研究成为热点。目前已发现许多自身抗体如单克隆及多克隆抗-DNA抗体，抗-RNP，抗淋巴细胞抗体、SSA、cANCA(抗蛋白酶3抗体)、抗Hu、抗核糖体P蛋白抗体等具有侵入活细胞的能力，且侵入细胞的过程是动态的，具有时间和温度依赖性，并受细胞分化、激活状态和外界因素影响。这种作用于细胞内的机制称为“抗体内化”，抗体内化的机制还不清楚，可能像激素、细胞因子发挥作用一样；先与细胞表面特定的受体作用，然后通过内吞或内饮进入细胞。 copyright sysqy.com
有研究资料表明，抗-DNA抗体和抗-Ku抗体内化后具致病作用，可分别导致肾小球足突细胞融合，蛋白尿，肾小球细胞增生和神经元类癌、脑脊髓炎；抗-RNP抗体可阻止T细胞从GO／G1期进入S和G2期，并使Ts细胞抑制功能丧失；抗-RPP抗体和抗-dsDNA抗体可抑制细胞内蛋白质合成；侵入性抗-Sm抗体进入T细胞后，可干扰T细胞的某些功能并产生一定程度的细胞毒作用。
抗体穿透细胞膜进入活细胞这一现象虽被观察到，但其真正的意义尚待弄清，可能是：作为调节因子起作用。如自身抗体进入产生自身抗体的B细胞，促使其凋亡，从而减少自身抗体的产生；也可能是作为发病因子起作用，即自身抗体进入靶细胞组织，如风湿性关节炎的滑膜细胞，SS中的唾液腺细胞，而不是淋巴细胞，导致靶细胞凋亡，引起组织细胞的死亡。
