液相色谱法在生化方面的实际应用主要方向是分析嘌呤、嘧啶基的核甙或核甙酸及具有相应的肽和蛋白质。
①在细胞核中有种类繁多的甙及核甙酸，可用不同的检测器或酶转移检测器或利用酶反应进行定性测定。用离子交换柱和缓冲游泳梯度淋洗。C18柱用含磷酸的缓冲水溶液的梯度淋洗法均能得到满意的结果。
②分析核酸近年来有关分析核酸的研究很多，主要是分离RNA、DNA及碎片。现在使用硅烷化的硅藻土或长碳链季胺盐涂渍＝在上面制成系列填充柱。已能分离t-RNA,r-RNA及DNV碎片。有没的缓冲液淋洗，还可利用此技术做RNA碎片的序列分离制备工具，对生物研究起了重要的作用。
③氨基酸、肽、蛋白质的分析，氨基酸分析主要是制成荧光衍生物或酰氯的衍生物，然后测定其序列。近来也可用高效液相色谱的柱后衍生物法测定其序列。操作简便、速度快、深受欢迎。用四烷基氯化胺肽形成离子对或高效凝胶色谱测定蛋白质，其分离效果也很好。
④酶的分析，酶是在血清及其他生理样品中常有的反应产物，化学分析法操作不便，易造成误差，用色谱技术分析，具有操作简便、快速、准确的特点。如测定碱性或酸性磷酸酶的含量，测定反应产物中腺甙脱 胺酶的含量等，目前对酶用色谱法分离分析的研究工作已开展很多。
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⑤糖的分析，糖的分析是其它方法较难完成的。如把糖与硼酸缓冲液预选混合，使生成糖-硼酸络合离子，再进行分离。可把蔗乳糖、阿芦糖、果糖、阿拉伯糖、岩藻糖、半乳糖、山梨糖、木糖、葡萄糖等几十种，全部分开。也可用胺基柱分离各种天然产物中伯糖的各绷分。
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